<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Journal of Clinical Practice</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Journal of Clinical Practice</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Клиническая практика</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-3095</issn><issn publication-format="electronic">2618-8627</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Eco-Vector</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">278280</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.17816/clinpract278280</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>Original Study Articles</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>Оригинальные исследования</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">A fluorescent microspheres-based microfluidic test system for the detection of immunoglobulin G to SARS-CoV-2</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Разработка микрофлюидной тест-системы на основе флюоресцентных микросфер для обнаружения иммуноглобулинов класса G к SARS-CoV-2</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-5986-0676</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">9576-8093</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Shakurov</surname><given-names>Ruslan I.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Шакуров</surname><given-names>Руслан Ильдарович</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Junior Research Associate</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>м.н.с.</p></bio><email>ruslan.shakurov@rcpcm.org</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-4672-2474</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">7640-5940</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Shansky</surname><given-names>Yaroslav D.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Шанский</surname><given-names>Ярослав Дмитриевич</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, Research Associate</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.б.н., н.с.</p></bio><email>yar.shansky@rcpcm.org</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-7244-5741</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">9244-6581</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Prusakov</surname><given-names>Kirill A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Прусаков</surname><given-names>Кирилл Александрович</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Research Associate</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>н.с.</p></bio><email>k.prusakov@rcpcm.org</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-0846-4670</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">4322-1945</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Sizova</surname><given-names>Svetlana V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Сизова</surname><given-names>Светлана Викторовна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, Research Associate</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.х.н., н.с.</p></bio><email>sv.sizova@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-3157-5902</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">8007-1870</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Dudik</surname><given-names>Stepan P.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Дудик</surname><given-names>Степан Павлович</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><email>stepan.dudik@rcpcm.org</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Plotnikova</surname><given-names>Lyudmila V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Плотникова</surname><given-names>Людмила Валерьевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><email>ntmdfs@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff4"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-2471-0563</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">9010-4521</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Manuvera</surname><given-names>Valentin A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Манувера</surname><given-names>Валентин Александрович</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, Senior Research Assistant</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.б.н., с.н.с.</p></bio><email>vmanuvera@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-8288-2198</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">9830-8561</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Klinov</surname><given-names>Dmitry V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Клинов</surname><given-names>Дмитрий Владимирович</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.ф.-м.н.</p></bio><email>klinov.dmitry@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-0042-966X</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">1578-8932</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Lazarev</surname><given-names>Vassili N.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Лазарев</surname><given-names>Василий Николаевич</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.б.н.</p></bio><email>lazar0@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4408-503X</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">6003-9246</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Bespyatykh</surname><given-names>Julia A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Беспятых</surname><given-names>Юлия Андреевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.б.н.</p></bio><email>JuliaBes@rcpcm.org</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/><xref ref-type="aff" rid="aff4"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-6620-7360</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">1801-6408</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Basmanov</surname><given-names>Dmitriy V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Басманов</surname><given-names>Дмитрий Викторович</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Research Associate</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>научный сотрудник</p></bio><email>dmitry.basmanov@rcpcm.org</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Lopukhin Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины имени академика Ю.М. Лопухина</institution></aff><aff><institution xml:lang="zh"></institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Lopukhin Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины имени академика Ю.М. Лопухина</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff3"><aff><institution xml:lang="en">Shemyakin &amp; Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff4"><aff><institution xml:lang="en">Mendeleev University of Chemical Technology of Russia</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Российский химико-технологический университет имени Д.И. Менделеева</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2023-04-11" publication-format="electronic"><day>11</day><month>04</month><year>2023</year></pub-date><volume>14</volume><issue>1</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>44</fpage><lpage>53</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2023-02-23"><day>23</day><month>02</month><year>2023</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2023-03-01"><day>01</day><month>03</month><year>2023</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2023, Shakurov R.I., Shansky Y.D., Prusakov K.A., Sizova S.V., Dudik S.P., Plotnikova L.V., Manuvera V.A., Klinov D.V., Lazarev V.N., Bespyatykh J.A., Basmanov D.V.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2023, Шакуров Р.И., Шанский Я.Д., Прусаков К.А., Сизова С.В., Дудик С.П., Плотникова Л.В., Манувера В.А., Клинов Д.В., Лазарев В.Н., Беспятых Ю.А., Басманов Д.В.</copyright-statement><copyright-year>2023</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Shakurov R.I., Shansky Y.D., Prusakov K.A., Sizova S.V., Dudik S.P., Plotnikova L.V., Manuvera V.A., Klinov D.V., Lazarev V.N., Bespyatykh J.A., Basmanov D.V.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Шакуров Р.И., Шанский Я.Д., Прусаков К.А., Сизова С.В., Дудик С.П., Плотникова Л.В., Манувера В.А., Клинов Д.В., Лазарев В.Н., Беспятых Ю.А., Басманов Д.В.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://clinpractice.ru/clinpractice/article/view/278280">https://clinpractice.ru/clinpractice/article/view/278280</self-uri><abstract xml:lang="en"><p><bold>Background:</bold> The pandemic of the new coronavirus infection, COVID-19, is currently ongoing in the world. Over the years, the pathogen, SARS-CoV-2, has undergone a series of mutational genome changes, which has led to the spread of various genetic variants of the virus. Meanwhile, the methods used to diagnose SARS-CoV-2, to establish the disease stage and to assess the immunity, are nonspecific to SARS-CoV-2 variants and time-consumable. Thus, the development of new methods for diagnosing COVID-19, as well as their implementation in practice, is currently an important direction. In particular, application of systems based on chemically modified fluorescent microspheres (with a multiplex assay for target protein molecules) opens great opportunities.</p> <p><bold>Aim:</bold> development of a microfluidic diagnostic test system based on fluorescent microspheres for the specific detection of immunoglobulins G (IgG) to SARS-CoV-2.</p> <p><bold>Methods:</bold> A collection of human serum samples was characterized using enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and commercially available reagent kits. IgG to SARS-CoV-2 in the human serum were detected by the developed immunofluorescent method using microspheres containing the chemically immobilized RBD fragment of the SARS-CoV-2 (“Kappa” variant) viral S-protein.</p> <p><bold>Results:</bold> The level of IgG in the blood serum of recovered volunteers was 9-300 times higher than that in apparently healthy volunteers, according to ELISA (p&lt;0.001). Conjugates of fluorescent microspheres with the RBD-fragment of the S-protein, capable of specifically binding IgG from the blood serum, have been obtained. The immune complexes formation was confirmed by the fluorescence microscopy data; the fluorescence intensity of secondary antibodies in the immune complexes formed on the surface of microspheres was proportional to the content of IgG (r 0.963). The test system had a good predictive value (AUC 70.3%).</p> <p><bold>Conclusion:</bold> A test system has been developed, based on fluorescent microspheres containing the immobilized RBD fragment of the SARS-CoV-2 S-protein, for the immunofluorescent detection of IgG in the human blood serum. When testing the system on samples with different levels of IgG to SARS-CoV-2, its prognostic value was shown. The obtained results allow us to present the test system as a method to assess the level of immunoglobulins to SARS-CoV-2 in the human blood serum for the implementation in clinical practice. The test system can also be integrated into various microfluidic systems to create chips and devices for the point-of-care diagnostics.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p><bold>Обоснование.</bold> С 2019 года весь мир охватила пандемия новой коронавирусной инфекции COVID-19, которая продолжается по сей день. За эти годы возбудитель SARS-CoV-2 претерпел ряд мутационных изменений в геноме, что повлекло распространение различных генетических вариантов вируса. Между тем для диагностики этиологического агента, установления стадии заболевания и оценки иммунитета используются методы, неспецифичные в отношении различных вариантов SARS-CoV-2 и требующие значительных временных затрат. Таким образом, актуальным направлением является разработка новых методов диагностики COVID-19, а также внедрение данных разработок в практику. Широкие возможности в этом направлении открывают системы на основе химически модифицированных флюоресцентных микросфер с возможностью мультиплексного анализа целевых белковых молекул.</p> <p><bold>Цель исследования</bold> — разработка микрофлюидной тест-системы на основе флюоресцентных микросфер для специфического обнаружения иммуноглобулинов класса G (IgG) к SARS-CoV-2.</p> <p><bold>Методы.</bold> Формирование охарактеризованной коллекции образцов сыворотки крови человека с использованием иммуноферментного анализа и коммерчески доступных наборов реагентов. Обнаружение IgG к SARS-CoV-2 в сыворотке крови человека, содержащей известный уровень антител, разработанным иммунофлюоресцентным методом с использованием микросфер, на поверхности которых химическим путем был иммобилизован RBD-фрагмент S-белка вируса SARS-CoV-2, вариант Каппа.</p> <p><bold>Результаты.</bold> Согласно данным иммуноферментного анализа, уровень IgG в сыворотке крови добровольцев в группе, перенесших коронавирусную инфекцию, в 9–300 раз превышал таковой в группе условно здоровых добровольцев, не болевших COVID-19. Получены конъюгаты флюоресцентных микросфер с RBD-фрагментом S-белка, способные специфически связывать IgG из сыворотки крови. Образование иммунных комплексов подтверждено данными флюоресцентной микроскопии: интенсивность флюоресценции вторичных антител в иммунных комплексах при их образовании на поверхности флюоресцентных микросфер прямо пропорциональна содержанию IgG (r=0,963). Тест-система обладает хорошей прогностической значимостью (AUC 70,3%).</p> <p><bold>Заключение.</bold> Разработана тест-система на основе флюоресцентных микросфер, содержащих иммобилизованный RBD-фрагмент S-белка SARS-CoV-2, для иммунофлюоресцентного выявления IgG в сыворотке крови человека. При апробации системы на образцах сыворотки крови добровольцев с различным уровнем IgG к SARS-CoV-2 показана ее прогностическая ценность, что позволяет позиционировать представленную тест-систему как метод оценки содержания иммуноглобулинов к SARS-CoV-2 в сыворотке крови человека с перспективой внедрения в клиническую практику. Представленная тест-система может быть использована также для интеграции в различные микрофлюидные системы и создания чипов и приборов «прикроватной диагностики».</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>enzyme-linked immunosorbent assay</kwd><kwd>ELISA</kwd><kwd>COVID-19 testing</kwd><kwd>personalized medicine</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>диагностика COVID-19</kwd><kwd>иммуноферментный анализ</kwd><kwd>персонализированная медицина</kwd></kwd-group><funding-group><award-group><funding-source><institution-wrap><institution xml:lang="ru">Научное исследование проведено при поддержке гранта Президента Российской Федерации</institution></institution-wrap><institution-wrap><institution xml:lang="en">This work was supported by the grant of the President of Russian Federation</institution></institution-wrap></funding-source><award-id>МК-2988.2022.3</award-id></award-group></funding-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>World Health Organization. Tracking SARS-CoV-2 variants [cited 2023 February, 20]. Режим доступа: https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/. Дата обращения: 20.02.2023.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Баклаушев В.П., Юсубалиева Г.М., Бычинин М.В., и др. Рациональная стратегия поддержания противовирусного иммунитета к новым вариантам SARS-CoV-2 // Клиническая практика. 2022. Т. 13, № 3. С. 43–55. [Baklaushev VP, Yusubalieva GM, Bychinin MV, et al. A rational strategy for the maintenance of antiviral immunity to new SARS-CoV-2 strains. Journal of Clinical Practice. 2022;13(3):43–55. (In Russ).] doi: 10.17816/clinpract111120</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Fernandes RS, de Oliveira Silva J, Gomes KB, et al. Recent advances in point of care testing for COVID-19 detection. Biomed Pharmacother 2022;153:113538. doi: 10.1016/J.BIOPHA.2022.113538</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Filchakova O, Dossym D, Ilyas A, et al. Review of COVID-19 testing and diagnostic methods. Talanta 2022;244:123409. doi: 10.1016/J.TALANTA.2022.123409</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Farmer S, Razin V, Peagler AF, et al. Don’t forget about human factors: Lessons learned from COVID-19 point-of-care testing. Cell Reports Methods 2022;2:100222. doi: 10.1016/J.CRMETH.2022.100222</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Zhong Z, Wang J, He S, et al. An encodable multiplex microsphere-phase amplification sensing platform detects SARS-CoV-2 mutations. Biosens Bioelectron. 2022;203:114032.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Патент РФ № RU 200301 U1/2020.10.15. Прусаков К.А., Басманов Д.В., Алдаров К.Г., и др. Микрофлюидный чип для проведения многопараметрического иммуноанализа. [Patent RUS № RU 200301 U1/2020.10.15. Prusakov KA, Basmanov DV, Aldarov KG, et al. Microfluidic chip for multiparametric immunoassay. (In Russ).] Режим доступа: https://yandex.ru/patents/doc/RU200301U1_20201015. Дата обращения: 20.02.2023.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Yuan H, Chen P, Wan C, et al. Merging microfluidics with luminescence immunoassays for urgent point-of-care diagnostics of COVID-19. TrAC Trends Anal Chem 2022; 157:116814. doi: 10.1016/J.TRAC.2022.116814</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Sheridan C. Fast, portable tests come online to curb coronavirus pandemic. Nat Biotechnol 2020;38:515–518. doi: 10.1038/D41587-020-00010-2</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Drain PK, Ampajwala M, Chappel C, et al. A rapid, high-sensitivity SARS-CoV-2 nucleocapsid immunoassay to aid diagnosis of acute COVID-19 at the point of care: A clinical performance study. Infect Dis Ther. 2021;10:753–761. doi: 10.1007/S40121-021-00413-X/FIGURES/2</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Chen R, Ren C, Liu M, et al. Early detection of SARS-CoV-2 seroconversion in humans with aggregation-induced near-infrared emission nanoparticle-labeled lateral flow immunoassay. ACS Nano. 2021;15:8996–9004. doi: 10.1021/ACSNANO.1C01932</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Zhou Y, Chen Y, Liu W, et al. Development of a rapid and sensitive quantum dot nanobead-based double-antigen sandwich lateral flow immunoassay and its clinical performance for the detection of SARS-CoV-2 total antibodies. Sensors Actuators B Chem 2021;343:130139. doi: 10.1016/J.SNB.2021.130139</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Hajazadeh F, Khanizadeh S, Khodadadi H, et al. SARS-COV-2 RBD (Receptor binding domain) mutations and variants (A sectional-analytical study). Microb Pathog 2022;168:105595. doi: 10.1016/J.MICPATH.2022.105595</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Heggestad JT, Kinnamon DS, Olson LB, et al. Multiplexed, quantitative serological profiling of COVID-19 from blood by a point-of-care test. Sci Adv 2021;7:4901–4926. doi: 10.1126/SCIADV.ABG4901/SUPPL_FILE/ABG4901_SOURCE_DATA.XLSX</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Gan HH, Zinno J, Piano F, Gunsalus KC. Omicron spike protein has a positive electrostatic surface that promotes ACE2 recognition and antibody escape. Front Virol 2022;2:43. doi: 10.3389/FVIRO.2022.894531</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
