кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории генетики ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России
заведующий Молекулярно-диагностической лабораторией ГАУЗ «Республиканский клинический онкологический диспансер МЗ Республики Татарстан»
кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории генетики ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России
кандидат биологических наук, заведующий лабораторией генетики ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России
заведующий отделением пульмонологии ФНКЦ ФМБА России,руководитель Центра биомедицинских технологий, д.м.н.
Definition of epigenetic disorders is important for early diagnosis of colorectal cancer. To obtain a model of diagnostic test system with high sensitivity and specificity, we determined the frequency of methylation in SEPT9 and VIM genes. Epigenetic events also were compared with mutations in the RAS family genes. It was confirmed the presence of aberrant methylation in SEPT9 and VIM genes in tumor cells. DNA of tumor samples was significantly more methylated than samples with DNA from adjacent tissue (P = 8,67E-19 for SEPT9 gene and P=8,68E-19 for VIM gene). In the group of patients carried mutations in KRAS or NRAS genes tumor DNA significantly more methylated in gene SEPT9 (P = 0.0018), in contrast to the tumor DNA from patients not carried mutations. We have demonstrated that the combined use of methylation markers can improve the sensitivity of the test systems used in the diagnostics of colon cancer.
Определение эпигенетических нарушений имеет большое значение для ранней диагностики колоректального рака (КРР). Для получения модели диагностической тест-системы с высокими показателями чувствительности и специфичности мы определяли частоту метилирования в генах SEPT9 и VIM. При анализе эпигенетических нарушений нами также учитывались мутации в генах семейства RAS. В нашей работе подтверждается наличие аберрантного метилирования в генах SEPT9 и VIM в клетках опухоли. ДНК образцов опухоли была достоверно чаще метилирована, чем ДНК образцов прилежащей ткани (P =8,67E-19 для гена SEPT9 и P=8,68E-19 для гена VIM). В группе пациентов, имеющих мутации в генах KRAS или NRAS, ДНК опухолевых образцов достоверно чаще метилирована в генe SEPT9 (P=0.0018), в отличие от ДНК опухолевых образцов пациентов, не несущих данных мутаций. Нами было продемонстрировано, что использование совокупности маркеров метилирования позволяет улучшить чувствительность тест- систем, используемых в диагностике КРР.